viernes, 18 de septiembre de 2009

Caprichosa belleza.

Si un alambre circular, por el que circula una corriente eléctrica, es colocado dentro de un campo magnético, éste experimenta un momento de torsión, debido al campo, que lo hace girar. 

Si un alambre circular por el que no circula corriente eléctrica se coloca dentro de un campo magnético, y un agente externo aplica un momento de torsión de tal forma que lo hace girar; lo que se observa en el alambre es el reflejo de la simetría de la naturaleza y su caprichosa belleza.

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Aparece una corriente eléctrica.

miércoles, 16 de septiembre de 2009

La paradoja de Levinthal

Levinthal ideó un experimento mental en el marco del plegamiento de las proteínas en el año 1969. Aunque bien puede extrapolarse a otros ámbitos para convencernos de que practicamente nada en nuestros cuerpos está librado al azar. Pero antes de comentar el experimento vamos a repasar un poco de estructura y estabilidad de moléculas.

Las proteínas son compuestos orgánicos hechos de aminoácidos en un arreglo lineal que adoptan una forma globular. El gen que codifica a la proteína se encuentra en el ADN, que mediante un proceso de transcripción origina el mRNA. El mRNA viaja al ribosoma donde comienza la traducción y biosíntesis de la proteína.

Existen tres niveles de estructura en una proteína. La estructura primaria es la secuencia lineal de aminoácidos. La estructura secundaria son estructuras dentro de una proteína formada por aminoácidos cercanos en la secuencia. Se destacan las hélices alfa, hojas beta y loops. Finalmente, la estructura terciaria vendría a ser la forma 3D de la proteína.

Cuando la proteína sale del ribosoma sale como la secuencia lineal de aminoácidos, esto es, solamente con estructura primaria. Luego sufre un proceso de plegamiento donde adquiere la estructura secundaria y terciaria. Dada la cantidad de aminoácidos que puede tener una proteína (la cadena puede tener entre 500 y 5000 residuos) existen innúmeras conformaciones posibles para una proteína. De todas esas conformaciones, solamente una es la proteína nativa, la de menor energía.

A esta altura puede surgir una pregunta interesante: la proteína, ¿se pliega al azar o de alguna forma "sabe" como plegarse? He aquí la paradoja de Levinthal:

Supongamos que tengo una proteína de 100 aminoácidos (bastante chica, comparada con los valores posibles). Cada aminoácido puede estar en 3 posibles formas: hélice alfa, hoja beta o loop. O sea, eso nos deja con 3^100 conformaciones posibles. Eso es equivalente a 5x10^47, un 5 con 47 ceros seguidos. El tiempo de rotación de un enlace químico es del orden de los picosegundos (10^-12 segundos). Si la molécula explora cada conformación en ese tiempo, ¿cuanto tardaria en explorar todas las conformaciones posibles y encontrar la estructura nativa? La respuesta es 1,6x10^28 años. Pensar que el universo tiene "tán solo" 10^10 años...

¿Que conclusiones podemos sacar de este experimento? Claramente el plegado de las proteínas no es un proceso azaroso. De hecho, las proteínas se pliegan en 0,1-1000 segundos. Más adelante se demostró con experimentos que la estructura nativa de la proteína depende exclusivamente de la estructura primaria. O sea, la proteína ya es sintetizada sabiendo que conformación espacial debe adoptar.

Asi que ya sabés, si una cosa tan pedorra como una secuencia de aminoácidos puede ser tan ordenada no tenés excusa para el vórtice de entropía que te da por llamar "mi cuarto".

lunes, 14 de septiembre de 2009

El Acertijo Nerd Nº1

Es sencillo gente(suponiendo que califiquen como tal)! Semana a semana, iremos posteando un acertijo nerd! Preferentemene serán del tipo "dibujo que representa algun concepto de la ciencia" al estilo de este post. Si aciertan pueden ganar fabulosisisisisimos premios(pero no les vamos a decir cuáles)

La respuesta la semana que viene....si hay más de dos comentarios. Kudos to the Viking for the art, All Hail The Photoshop Master With Horns.

domingo, 23 de agosto de 2009

What Should We Do Now?

Nervios. Ansias. Hojas y hojas escritas, garabateadas, libros y apuntes desparramados por todos lados, fundiendose con las ropas, el mantel, la silla y el lector mismo. Una mancha de mate asoma, simétrica sobre el costado del parcial que te puso en este aprieto. Neuronas quemadas, noches de dormir poco, ciclotimia de estudiar, comer, seguir estudiando, dormir; y volver a empezar. Un pedacito de tu cabeza se rebela y empieza a ametrallar:"No tengo vida","en que carajo me meti?" "porque no estudié otra cosa? Algo para ganar guita? Muuuucha guita?" "Hace cuánto que no salgo?". Y sin embargo seguís, rejuntando las ultimas fuerzas, rogando que no te tomen lo que estudiaste poco, que no te caguen con un parcial imposible de hacer, o con alguna boludez del tipo "eran milimierdas, no micromierdas leiste mal". Hasta que llega el día del parcial. Más nervios. Más ansias. Sudor frío en las manos. De repente te relajás. Ya está, no podes hacer nada más, alcanzás cierto grado de iluminación, un nirvana pasajero ante la contundencia de la hoja que tenes enfrente. No más enroscarte sobre qué te pueden tomar, no mas hacerte la cabeza. Solo te quedan 4 horas mas, y te vás a dormir(o a seguir estudiando, en mi caso). Respirás profundo y quemás tus últimos ATP'S en esguinzarte la muñeca(neuronas no te quedan más) escribiendo frenéticamente.
Tres semanas así, en las que rendí 4 recuperatorios en un lapso de 10 días. Y ahora escribo en la compu escuchando Peter Capusotto, en pleno huevo, sin preocupaciones esperando que alguno lea esto y se sienta identificado. Pero....Y ahora qué? Como me bajo de la inercia post-parcial?

viernes, 21 de agosto de 2009

Por cosas como esta tengo este blog...

Cierta vez, todos los científicos, ya muertos, que estaban en el cielo, se propusieron jugar a las escondidas. En el sorteo le tocó a Einstein comenzar contando.
Al comenzar Einstein su cuenta, todos salieron corriendo en distintas direcciones buscando un escondite. Todos menos Newton.
Newton, se dedicó simplemente a dibujar en el piso un cuadrado de 1 metro de lado y se paró dentro de él. Justo a espaldas de Einstein.
Einstein terminó su cuenta: 97, 98, 99, 100, abrió los ojos, dio media vuelta, y se encontró a Newton parado justo delante de sus ojos.
Einstein dijo: "¡¡Piedra libre para Newton!!, ¡¡Piedra libre para Newton!!"
Newton, negando con la cabeza, dijo:
- Tengo que discrepar. Yo no fui encontrado. Yo no soy Newton.
Ante el estupefacto Einstein, que miraba seriamente a Newton, todo el resto de los científicos salieron uno a uno de sus escondites, entre intrigados y sorprendidos, para finalmente escuchar una explicación de Newton con la que se vieron obligados a coincidir.
Newton dijo:
- Como verán, yo estoy parado en un área de 1 metro cuadrado. Por lo tanto, soy un Newton por metro cuadrado. En definitiva, yo soy Pascal.
Y Einstein, tuvo que volver a contar...

martes, 11 de agosto de 2009

Estudio Química.

Cada vez que me pongo en evidencia ante un ser del mundo real y le cuento lo que estudio, mis oídos se preparan para recibir las mismas palabras. Siempre obtengo las mismas respuestas.

'Ahhh , bioquímica! '

'química?! la que me llevé todo el secundario!!'

'uyy ...complicado no? debés ser superinteligente'

y la mas frecuente de todas, la que siempre lanzan acompañada con una cara que mezcla incomprensión, compasión y dolor :

'POR QUE?!'

A la primera siempre respondo instantánea e instintivamente, sin hacer demasiadas aclaraciones : 'NO. Bioquímica NO. LICENCIATURA!!' . La segunda y la tercera no suelen tener réplica en voz alta, una leve sonrisa intenta decir todo. Y la devolución a la cuarta oscila entre una encogida de hombros y un simple 'porque me gusta'. 

La pura verdad es que nunca tuve energía suficiente como para responder de manera completa a los comentarios post 'confesión nerd'. Creo ésta, una buena ocasión para hacerlo. Primera y última vez . Acá voy.

A la primera: SI DIGO QUÍMICA DIGO QUÍMICA y no otra cosa que suene parecido. La gente no se da cuenta de que los prefijos hacen a la palabra más específica y por ende la palabra con prefijo no quiere decir todo lo que quiere decir la palabra sin prefijo??  NO. Bioquímica no. Estudio Química, aunque Bioquímica suene parecido.

A la segunda y la tercera: Que te la hayas llevado todo el secundario no es un dato relevante para mi. Y si soy super inteligente? Si mi trasero no se estuviese quedando sin raya de tantas horas cullo-silla, si me alcanzara con ir a clase y no necesitara sumergirme en libros de mas de 2mil páginas para entender de que están hablando, si acepto cursar materias de 16hs semanales, rendir los sábados, cursar 8hs seguidas de laboratorio, tener parciales de 4hs como mínimo y  aun sabiendo que haciendo ciencia probablemente me cague de hambre, pudiendo elegir una licenciatura en marketing con todo lo que eso significa...la verdad no, no creo que sea superinteligente. No se que significa ser super inteligente.

A la última: Hay varias razones de POR QUE. No es masoquismo gratis. No me odio. En principio, me considero una persona extremadamente curiosa, que ante cada fenómeno siempre quiere llegar al meollo de la cuestión para poder entenderlo bien. Pero además, y es en ESTO en lo que creo yo que reside nuestra (famosa?) inteligencia, estudiar ciencias exactas es mucho más fácil que estudiar algunas otras cosas. Y eso es indiscutible. O me van a decir que estudiar procesos históricos que se modifican a través del tiempo y que no tienen clara fecha de inicio y finalización, que son producto de cambios en las maneras de pensar del ser humano, pero no del ser humano como individuo sino el pensamiento en masa, de miles de seres humanos, que dan origen a diferentes corrientes ideológicas, influidas unas por otras y por el entorno, y éste a su vez, definido por incontables variables cuyo comportamiento es completamente impredecible; es más fácil que estudiar un resorte? Más aún, después de que uno ha logrado la capacidad de abstracción suficiente como para reducir los casos más complejos a casos simples, como decir que cuando una molécula vibra, lo hace como un resorte.

En el fondo es eso. No estudiamos bioquímica, estudiamos química, porque queremos saber todo, no solo una parte. Y no creo que seamos más inteligentes; somos mas curiosos, mas insistentes y más astutos; porque estudiamos esto porque es más fácil, y lo simple es hermoso.

Probablemente, alguien pueda contestar una pregunta referida a algún tópico humanístico sin saber muy bien que está diciendo, y sonar como un total entendido. No creo que existan muchas personas en el mundo que sepan sobre ciencias sociales. Contestar una pregunta en ciencias exactas, requiere no sólo saber bien de que se está hablando, sino también razonar , abstraerse, simplificar, analizar la validez del razonamiento y seguramente resolver algunas integrales bastante chotas. Pero al fin y al cabo, son cuentitas. La recompensa? el conocimiento más preciado de todos:

la predicción.

domingo, 9 de agosto de 2009

Bordeando el cero absoluto

Entre las vacaciones prolongadas por la fiebre porcina y los parciales/recuperatorios haciendo estragos con la entropía del universo hemos desatendido totalmente este blog. Pero no temais, oh amigos ñoños, en breve volvemos con todo.
Ahora sigo estudiando... si, sabado a la madrugada estudiando... estúpida termodinámica.